Protein–RNA interactions for Protein: Q9H944

MED20, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED20Q9H944 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED20Q9H944 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED20Q9H944 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED20Q9H944 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED20Q9H944 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED20Q9H944 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED20Q9H944 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED20Q9H944 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED20Q9H944 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED20Q9H944 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED20Q9H944 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED20Q9H944 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED20Q9H944 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED20Q9H944 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED20Q9H944 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED20Q9H944 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MED20Q9H944 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED20Q9H944 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms