Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCAS3Q9H6U6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
BCAS3Q9H6U6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BCAS3Q9H6U6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCAS3Q9H6U6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCAS3Q9H6U6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCAS3Q9H6U6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCAS3Q9H6U6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCAS3Q9H6U6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BCAS3Q9H6U6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCAS3Q9H6U6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCAS3Q9H6U6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCAS3Q9H6U6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCAS3Q9H6U6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCAS3Q9H6U6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
BCAS3Q9H6U6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCAS3Q9H6U6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCAS3Q9H6U6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCAS3Q9H6U6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCAS3Q9H6U6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCAS3Q9H6U6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCAS3Q9H6U6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.8 ms