Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1X1

RSPH9, Radial spoke head protein 9 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH9Q9H1X1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPH9Q9H1X1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RSPH9Q9H1X1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RSPH9Q9H1X1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms