Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHE41Q9C0J9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHLHE41Q9C0J9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
BHLHE41Q9C0J9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHLHE41Q9C0J9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHLHE41Q9C0J9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHLHE41Q9C0J9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHLHE41Q9C0J9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHE41Q9C0J9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHE41Q9C0J9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHE41Q9C0J9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHE41Q9C0J9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms