Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD6Q9BRQ6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD6Q9BRQ6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD6Q9BRQ6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD6Q9BRQ6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD6Q9BRQ6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD6Q9BRQ6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD6Q9BRQ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD6Q9BRQ6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD6Q9BRQ6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD6Q9BRQ6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHCHD6Q9BRQ6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHCHD6Q9BRQ6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHCHD6Q9BRQ6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHCHD6Q9BRQ6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms