Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PYM1Q9BRP8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PYM1Q9BRP8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PYM1Q9BRP8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PYM1Q9BRP8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PYM1Q9BRP8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PYM1Q9BRP8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PYM1Q9BRP8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PYM1Q9BRP8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PYM1Q9BRP8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PYM1Q9BRP8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PYM1Q9BRP8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PYM1Q9BRP8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PYM1Q9BRP8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PYM1Q9BRP8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PYM1Q9BRP8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PYM1Q9BRP8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PYM1Q9BRP8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PYM1Q9BRP8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PYM1Q9BRP8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PYM1Q9BRP8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PYM1Q9BRP8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PYM1Q9BRP8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PYM1Q9BRP8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PYM1Q9BRP8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PYM1Q9BRP8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PYM1Q9BRP8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PYM1Q9BRP8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PYM1Q9BRP8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PYM1Q9BRP8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PYM1Q9BRP8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PYM1Q9BRP8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PYM1Q9BRP8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PYM1Q9BRP8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PYM1Q9BRP8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PYM1Q9BRP8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PYM1Q9BRP8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PYM1Q9BRP8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PYM1Q9BRP8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PYM1Q9BRP8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PYM1Q9BRP8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PYM1Q9BRP8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PYM1Q9BRP8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PYM1Q9BRP8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PYM1Q9BRP8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PYM1Q9BRP8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms