Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX50Q9BQ39 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX50Q9BQ39 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
DDX50Q9BQ39 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX50Q9BQ39 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX50Q9BQ39 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX50Q9BQ39 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX50Q9BQ39 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX50Q9BQ39 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX50Q9BQ39 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX50Q9BQ39 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX50Q9BQ39 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX50Q9BQ39 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX50Q9BQ39 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX50Q9BQ39 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX50Q9BQ39 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX50Q9BQ39 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX50Q9BQ39 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX50Q9BQ39 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms