Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPA33Q99795 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPA33Q99795 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPA33Q99795 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPA33Q99795 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms