Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POP1Q99575 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POP1Q99575 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POP1Q99575 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POP1Q99575 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POP1Q99575 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POP1Q99575 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POP1Q99575 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POP1Q99575 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POP1Q99575 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POP1Q99575 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POP1Q99575 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POP1Q99575 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POP1Q99575 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POP1Q99575 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POP1Q99575 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POP1Q99575 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POP1Q99575 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POP1Q99575 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POP1Q99575 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POP1Q99575 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POP1Q99575 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POP1Q99575 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
POP1Q99575 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POP1Q99575 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
POP1Q99575 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
POP1Q99575 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POP1Q99575 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POP1Q99575 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POP1Q99575 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POP1Q99575 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POP1Q99575 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
POP1Q99575 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POP1Q99575 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POP1Q99575 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POP1Q99575 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POP1Q99575 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POP1Q99575 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POP1Q99575 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POP1Q99575 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POP1Q99575 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POP1Q99575 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POP1Q99575 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POP1Q99575 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POP1Q99575 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
POP1Q99575 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POP1Q99575 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POP1Q99575 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POP1Q99575 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POP1Q99575 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POP1Q99575 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POP1Q99575 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POP1Q99575 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POP1Q99575 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POP1Q99575 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POP1Q99575 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POP1Q99575 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POP1Q99575 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POP1Q99575 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
POP1Q99575 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POP1Q99575 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POP1Q99575 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POP1Q99575 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POP1Q99575 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POP1Q99575 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POP1Q99575 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POP1Q99575 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POP1Q99575 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POP1Q99575 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POP1Q99575 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POP1Q99575 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POP1Q99575 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POP1Q99575 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POP1Q99575 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POP1Q99575 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POP1Q99575 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POP1Q99575 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POP1Q99575 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POP1Q99575 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POP1Q99575 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POP1Q99575 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POP1Q99575 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POP1Q99575 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POP1Q99575 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POP1Q99575 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POP1Q99575 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POP1Q99575 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POP1Q99575 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POP1Q99575 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POP1Q99575 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POP1Q99575 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
POP1Q99575 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
POP1Q99575 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POP1Q99575 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POP1Q99575 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POP1Q99575 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POP1Q99575 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POP1Q99575 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POP1Q99575 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
POP1Q99575 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms