Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYCBPQ99417 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYCBPQ99417 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYCBPQ99417 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYCBPQ99417 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYCBPQ99417 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYCBPQ99417 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYCBPQ99417 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYCBPQ99417 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYCBPQ99417 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYCBPQ99417 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCBPQ99417 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCBPQ99417 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCBPQ99417 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCBPQ99417 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCBPQ99417 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCBPQ99417 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCBPQ99417 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCBPQ99417 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MYCBPQ99417 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MYCBPQ99417 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYCBPQ99417 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYCBPQ99417 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYCBPQ99417 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms