Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCLRE1CQ96SD1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCLRE1CQ96SD1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms