Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB8

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC6Q96SB8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC6Q96SB8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC6Q96SB8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC6Q96SB8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMC6Q96SB8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMC6Q96SB8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMC6Q96SB8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms