Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SORCS2Q96PQ0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms