Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPR78Q96P69 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPR78Q96P69 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPR78Q96P69 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPR78Q96P69 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPR78Q96P69 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPR78Q96P69 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPR78Q96P69 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPR78Q96P69 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPR78Q96P69 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPR78Q96P69 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPR78Q96P69 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPR78Q96P69 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPR78Q96P69 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPR78Q96P69 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPR78Q96P69 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPR78Q96P69 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPR78Q96P69 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPR78Q96P69 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPR78Q96P69 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms