Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FAM227BQ96M60 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FAM227BQ96M60 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FAM227BQ96M60 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM227BQ96M60 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms