Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SAMD8Q96LT4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAMD8Q96LT4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD8Q96LT4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms