Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP8Q96LD8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SENP8Q96LD8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP8Q96LD8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP8Q96LD8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP8Q96LD8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP8Q96LD8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP8Q96LD8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP8Q96LD8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP8Q96LD8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SENP8Q96LD8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP8Q96LD8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP8Q96LD8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP8Q96LD8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SENP8Q96LD8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SENP8Q96LD8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP8Q96LD8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP8Q96LD8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP8Q96LD8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP8Q96LD8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP8Q96LD8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP8Q96LD8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SENP8Q96LD8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SENP8Q96LD8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SENP8Q96LD8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SENP8Q96LD8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SENP8Q96LD8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SENP8Q96LD8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SENP8Q96LD8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SENP8Q96LD8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SENP8Q96LD8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SENP8Q96LD8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SENP8Q96LD8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SENP8Q96LD8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SENP8Q96LD8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP8Q96LD8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP8Q96LD8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP8Q96LD8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP8Q96LD8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP8Q96LD8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SENP8Q96LD8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP8Q96LD8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP8Q96LD8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP8Q96LD8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP8Q96LD8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP8Q96LD8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP8Q96LD8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP8Q96LD8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP8Q96LD8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP8Q96LD8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP8Q96LD8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP8Q96LD8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP8Q96LD8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP8Q96LD8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP8Q96LD8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.6 ms