Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TMX3Q96JJ7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMX3Q96JJ7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMX3Q96JJ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMX3Q96JJ7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMX3Q96JJ7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMX3Q96JJ7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMX3Q96JJ7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMX3Q96JJ7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TMX3Q96JJ7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMX3Q96JJ7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMX3Q96JJ7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TMX3Q96JJ7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMX3Q96JJ7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMX3Q96JJ7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMX3Q96JJ7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TMX3Q96JJ7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMX3Q96JJ7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMX3Q96JJ7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMX3Q96JJ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMX3Q96JJ7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMX3Q96JJ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMX3Q96JJ7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMX3Q96JJ7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMX3Q96JJ7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMX3Q96JJ7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TMX3Q96JJ7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMX3Q96JJ7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMX3Q96JJ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMX3Q96JJ7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMX3Q96JJ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMX3Q96JJ7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TMX3Q96JJ7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMX3Q96JJ7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms