Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRIG1Q96JA1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRIG1Q96JA1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRIG1Q96JA1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRIG1Q96JA1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIG1Q96JA1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIG1Q96JA1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIG1Q96JA1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIG1Q96JA1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIG1Q96JA1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIG1Q96JA1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRIG1Q96JA1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIG1Q96JA1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIG1Q96JA1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIG1Q96JA1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIG1Q96JA1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIG1Q96JA1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRIG1Q96JA1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIG1Q96JA1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIG1Q96JA1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms