Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A3Q96HJ5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A3Q96HJ5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms