Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
LHX4Q969G2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
LHX4Q969G2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LHX4Q969G2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms