Protein–RNA interactions for Protein: Q92966

SNAPC3, snRNA-activating protein complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC3Q92966 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNAPC3Q92966 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNAPC3Q92966 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAPC3Q92966 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNAPC3Q92966 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms