Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC44A1Q8WWI5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC44A1Q8WWI5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms