Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKA2Q8WVK7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKA2Q8WVK7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKA2Q8WVK7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKA2Q8WVK7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SKA2Q8WVK7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKA2Q8WVK7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms