Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MYRIPQ8NFW9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYRIPQ8NFW9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MYRIPQ8NFW9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MYRIPQ8NFW9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYRIPQ8NFW9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYRIPQ8NFW9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYRIPQ8NFW9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYRIPQ8NFW9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYRIPQ8NFW9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYRIPQ8NFW9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYRIPQ8NFW9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MYRIPQ8NFW9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYRIPQ8NFW9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYRIPQ8NFW9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYRIPQ8NFW9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYRIPQ8NFW9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MYRIPQ8NFW9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYRIPQ8NFW9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYRIPQ8NFW9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYRIPQ8NFW9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYRIPQ8NFW9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYRIPQ8NFW9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYRIPQ8NFW9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MYRIPQ8NFW9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYRIPQ8NFW9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYRIPQ8NFW9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYRIPQ8NFW9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYRIPQ8NFW9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYRIPQ8NFW9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYRIPQ8NFW9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYRIPQ8NFW9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYRIPQ8NFW9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYRIPQ8NFW9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MYRIPQ8NFW9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYRIPQ8NFW9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MYRIPQ8NFW9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MYRIPQ8NFW9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MYRIPQ8NFW9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYRIPQ8NFW9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms