Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFP0

PXT1, Peroxisomal testis-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXT1Q8NFP0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PXT1Q8NFP0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PXT1Q8NFP0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PXT1Q8NFP0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PXT1Q8NFP0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXT1Q8NFP0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms