Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBOF1Q8ND07 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBOF1Q8ND07 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBOF1Q8ND07 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BBOF1Q8ND07 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBOF1Q8ND07 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BBOF1Q8ND07 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBOF1Q8ND07 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBOF1Q8ND07 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
BBOF1Q8ND07 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BBOF1Q8ND07 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBOF1Q8ND07 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BBOF1Q8ND07 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms