Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC89Q8N998 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC89Q8N998 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC89Q8N998 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC89Q8N998 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC89Q8N998 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC89Q8N998 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC89Q8N998 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC89Q8N998 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC89Q8N998 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC89Q8N998 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC89Q8N998 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC89Q8N998 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC89Q8N998 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC89Q8N998 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC89Q8N998 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC89Q8N998 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC89Q8N998 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC89Q8N998 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC89Q8N998 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC89Q8N998 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC89Q8N998 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC89Q8N998 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC89Q8N998 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC89Q8N998 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC89Q8N998 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC89Q8N998 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC89Q8N998 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC89Q8N998 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC89Q8N998 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC89Q8N998 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC89Q8N998 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC89Q8N998 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC89Q8N998 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC89Q8N998 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC89Q8N998 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC89Q8N998 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC89Q8N998 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC89Q8N998 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC89Q8N998 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC89Q8N998 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC89Q8N998 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC89Q8N998 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC89Q8N998 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms