Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00337Q8N6G1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00337Q8N6G1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms