Protein–RNA interactions for Protein: Q8N140

EID3, EP300-interacting inhibitor of differentiation 3, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EID3Q8N140 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EID3Q8N140 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EID3Q8N140 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms