Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPBP1Q86WP2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPBP1Q86WP2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
GPBP1Q86WP2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPBP1Q86WP2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPBP1Q86WP2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms