Protein–RNA interactions for Protein: Q86US8

SMG6, Telomerase-binding protein EST1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6Q86US8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMG6Q86US8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SMG6Q86US8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMG6Q86US8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMG6Q86US8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMG6Q86US8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
SMG6Q86US8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMG6Q86US8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SMG6Q86US8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMG6Q86US8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SMG6Q86US8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMG6Q86US8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SMG6Q86US8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
SMG6Q86US8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMG6Q86US8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMG6Q86US8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMG6Q86US8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SMG6Q86US8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMG6Q86US8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMG6Q86US8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SMG6Q86US8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMG6Q86US8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SMG6Q86US8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMG6Q86US8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMG6Q86US8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMG6Q86US8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SMG6Q86US8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMG6Q86US8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMG6Q86US8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMG6Q86US8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SMG6Q86US8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMG6Q86US8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SMG6Q86US8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
SMG6Q86US8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SMG6Q86US8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMG6Q86US8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SMG6Q86US8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SMG6Q86US8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMG6Q86US8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMG6Q86US8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMG6Q86US8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMG6Q86US8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SMG6Q86US8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMG6Q86US8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMG6Q86US8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMG6Q86US8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SMG6Q86US8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMG6Q86US8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMG6Q86US8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SMG6Q86US8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms