Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CCDC141Q6ZP82 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CCDC141Q6ZP82 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
CCDC141Q6ZP82 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC38■■■■□ 3.67
CCDC141Q6ZP82 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC141Q6ZP82 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC141Q6ZP82 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC141Q6ZP82 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC141Q6ZP82 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC141Q6ZP82 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC141Q6ZP82 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CCDC141Q6ZP82 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CCDC141Q6ZP82 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
CCDC141Q6ZP82 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CCDC141Q6ZP82 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
CCDC141Q6ZP82 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CCDC141Q6ZP82 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC141Q6ZP82 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CCDC141Q6ZP82 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CCDC141Q6ZP82 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CCDC141Q6ZP82 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CCDC141Q6ZP82 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CCDC141Q6ZP82 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CCDC141Q6ZP82 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CCDC141Q6ZP82 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC141Q6ZP82 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC141Q6ZP82 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CCDC141Q6ZP82 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CCDC141Q6ZP82 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CCDC141Q6ZP82 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CCDC141Q6ZP82 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CCDC141Q6ZP82 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CCDC141Q6ZP82 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CCDC141Q6ZP82 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CCDC141Q6ZP82 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CCDC141Q6ZP82 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CCDC141Q6ZP82 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CCDC141Q6ZP82 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC141Q6ZP82 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC141Q6ZP82 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC141Q6ZP82 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC141Q6ZP82 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CCDC141Q6ZP82 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC141Q6ZP82 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC141Q6ZP82 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC141Q6ZP82 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CCDC141Q6ZP82 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC141Q6ZP82 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC141Q6ZP82 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC141Q6ZP82 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CCDC141Q6ZP82 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC141Q6ZP82 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms