Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
WDR88Q6ZMY6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR88Q6ZMY6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR88Q6ZMY6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR88Q6ZMY6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms