Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCIMPQ6UWF3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCIMPQ6UWF3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCIMPQ6UWF3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCIMPQ6UWF3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCIMPQ6UWF3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCIMPQ6UWF3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCIMPQ6UWF3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCIMPQ6UWF3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCIMPQ6UWF3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCIMPQ6UWF3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCIMPQ6UWF3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCIMPQ6UWF3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCIMPQ6UWF3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCIMPQ6UWF3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCIMPQ6UWF3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCIMPQ6UWF3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCIMPQ6UWF3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCIMPQ6UWF3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCIMPQ6UWF3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCIMPQ6UWF3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms