Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED27Q6P2C8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MED27Q6P2C8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED27Q6P2C8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms