Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LETMD1Q6P1Q0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LETMD1Q6P1Q0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LETMD1Q6P1Q0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LETMD1Q6P1Q0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LETMD1Q6P1Q0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LETMD1Q6P1Q0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LETMD1Q6P1Q0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LETMD1Q6P1Q0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LETMD1Q6P1Q0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LETMD1Q6P1Q0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LETMD1Q6P1Q0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LETMD1Q6P1Q0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LETMD1Q6P1Q0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LETMD1Q6P1Q0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LETMD1Q6P1Q0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LETMD1Q6P1Q0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LETMD1Q6P1Q0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LETMD1Q6P1Q0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LETMD1Q6P1Q0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LETMD1Q6P1Q0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LETMD1Q6P1Q0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LETMD1Q6P1Q0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LETMD1Q6P1Q0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LETMD1Q6P1Q0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms