Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPPQ6IPU0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CENPPQ6IPU0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPPQ6IPU0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPPQ6IPU0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPPQ6IPU0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CENPPQ6IPU0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CENPPQ6IPU0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CENPPQ6IPU0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPPQ6IPU0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPPQ6IPU0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPPQ6IPU0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPPQ6IPU0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CENPPQ6IPU0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPPQ6IPU0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPPQ6IPU0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPPQ6IPU0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPPQ6IPU0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CENPPQ6IPU0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CENPPQ6IPU0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPPQ6IPU0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CENPPQ6IPU0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CENPPQ6IPU0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPPQ6IPU0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPPQ6IPU0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPPQ6IPU0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPPQ6IPU0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPPQ6IPU0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPPQ6IPU0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPPQ6IPU0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPPQ6IPU0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPPQ6IPU0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPPQ6IPU0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPPQ6IPU0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPPQ6IPU0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPPQ6IPU0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPPQ6IPU0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPPQ6IPU0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPPQ6IPU0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPPQ6IPU0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPPQ6IPU0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CENPPQ6IPU0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPPQ6IPU0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPPQ6IPU0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPPQ6IPU0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPPQ6IPU0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPPQ6IPU0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPPQ6IPU0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPPQ6IPU0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPPQ6IPU0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPPQ6IPU0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPPQ6IPU0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPPQ6IPU0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPPQ6IPU0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPPQ6IPU0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPPQ6IPU0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPPQ6IPU0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CENPPQ6IPU0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPPQ6IPU0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CENPPQ6IPU0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CENPPQ6IPU0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms