Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRTP1Q5TC63 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRTP1Q5TC63 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRTP1Q5TC63 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRTP1Q5TC63 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRTP1Q5TC63 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms