Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR44Q5JSH3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR44Q5JSH3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR44Q5JSH3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR44Q5JSH3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR44Q5JSH3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR44Q5JSH3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR44Q5JSH3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
WDR44Q5JSH3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
WDR44Q5JSH3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
WDR44Q5JSH3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
WDR44Q5JSH3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
WDR44Q5JSH3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
WDR44Q5JSH3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
WDR44Q5JSH3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
WDR44Q5JSH3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
WDR44Q5JSH3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
WDR44Q5JSH3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms