Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C3orf38Q5JPI3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C3orf38Q5JPI3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C3orf38Q5JPI3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms