Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCDC93Q567U6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC93Q567U6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC93Q567U6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC93Q567U6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.2 ms