Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO43Q4G163 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO43Q4G163 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FBXO43Q4G163 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO43Q4G163 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO43Q4G163 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms