Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP5B1Q2VPB7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP5B1Q2VPB7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AP5B1Q2VPB7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms