Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPTX1Q15818 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPTX1Q15818 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPTX1Q15818 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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