Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT31Q15323 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT31Q15323 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT31Q15323 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
KRT31Q15323 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT31Q15323 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT31Q15323 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms