Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CUL4AQ13619 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CUL4AQ13619 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CUL4AQ13619 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CUL4AQ13619 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CUL4AQ13619 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CUL4AQ13619 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CUL4AQ13619 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CUL4AQ13619 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CUL4AQ13619 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CUL4AQ13619 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CUL4AQ13619 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CUL4AQ13619 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CUL4AQ13619 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
CUL4AQ13619 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CUL4AQ13619 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CUL4AQ13619 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CUL4AQ13619 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CUL4AQ13619 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CUL4AQ13619 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CUL4AQ13619 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CUL4AQ13619 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CUL4AQ13619 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CUL4AQ13619 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CUL4AQ13619 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CUL4AQ13619 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CUL4AQ13619 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CUL4AQ13619 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CUL4AQ13619 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CUL4AQ13619 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CUL4AQ13619 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CUL4AQ13619 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CUL4AQ13619 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CUL4AQ13619 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CUL4AQ13619 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CUL4AQ13619 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CUL4AQ13619 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CUL4AQ13619 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CUL4AQ13619 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CUL4AQ13619 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
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