Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NR1H3Q13133 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR1H3Q13133 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms