Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GPS1Q13098 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPS1Q13098 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GPS1Q13098 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPS1Q13098 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPS1Q13098 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
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