Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNMA1Q12791 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNMA1Q12791 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNMA1Q12791 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNMA1Q12791 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNMA1Q12791 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNMA1Q12791 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNMA1Q12791 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNMA1Q12791 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNMA1Q12791 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNMA1Q12791 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNMA1Q12791 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNMA1Q12791 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNMA1Q12791 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNMA1Q12791 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNMA1Q12791 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNMA1Q12791 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
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